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化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算 版權(quán)信息
- ISBN:9787562328544
- 條形碼:9787562328544 ; 978-7-5623-2854-4
- 裝幀:暫無
- 冊數(shù):暫無
- 重量:暫無
- 所屬分類:>>
化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算 本書特色
《化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算》可作為化學(xué)及相關(guān)專業(yè)高年級本科生、研究生的教材和化學(xué)專業(yè)教師及有關(guān)研究人員的參考書,也可作為相關(guān)軟件的使用參考書。
化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算 內(nèi)容簡介
本書以著名的桌面化學(xué)辦公系統(tǒng)軟件chembiooffice2008和廣泛使用的量化計算軟件gaussian03的使用為例,采用圖形界面與文字?jǐn)⑹鱿鄬φ盏姆绞剑敿?xì)介紹了化學(xué)圖文設(shè)計和分子模擬計算的方法。內(nèi)容包括:計算機(jī)化學(xué)及化學(xué)模擬的概念與方法;chemsketch化學(xué)圖文繪制技巧;chembiodraw化學(xué)生物繪圖工具的使用方法、結(jié)構(gòu)查詢、結(jié)構(gòu)與性質(zhì)計算;chembio3d結(jié)構(gòu)模型構(gòu)建、修改、顯示與輸出的方法和技巧;chembio3d中量子化學(xué)接口軟件(mopac、gaussian、jaguar等)在分子模擬計算中的應(yīng)用;gaussian03輸入文件的編制、計算作業(yè)的運(yùn)行、計算結(jié)果的觀察等方法;利用gaussview4.1創(chuàng)建、設(shè)置、運(yùn)行與觀察gaussian輸入/輸出文件的方法。書中采用眾多計算實例,介紹了單點(diǎn)能計算、幾何優(yōu)化計算、頻率計算、高精度計算、化學(xué)反應(yīng)路徑計算、激發(fā)態(tài)的計算和溶液中的模擬等計算方法和計算結(jié)果的查看。
本書可作為化學(xué)及相關(guān)專業(yè)高年級本科生、研究生的教材和化學(xué)專業(yè)教師及有關(guān)研究人員的參考書,也可作為相關(guān)軟件的使用參考書。
化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算 目錄
1.1 計算機(jī)與化學(xué)
1.1.1 計算機(jī)化學(xué)
1.1.2 計算化學(xué)
1.1.3 理論化學(xué)
1.1.4 量子化學(xué)
1.2 計算機(jī)化學(xué)的發(fā)展
1.3 我國計算(機(jī))化學(xué)的發(fā)展概況
1.4 分子模擬與量化計算簡介
1.4.1 分子模擬的意義
1.4.2 分子模擬的一般過程
1.4.3 分子模型的構(gòu)建
1.4.4 分子模擬的方法
1.5 常用化學(xué)軟件簡介
1.5.1 化學(xué)圖文設(shè)計軟件
1.5.2 計算化學(xué)與分子模擬軟件
1.5.3 化學(xué)數(shù)據(jù)庫
1.5.4 圖譜解析軟件
1.5.5 數(shù)據(jù)處理軟件
1.5.6 文獻(xiàn)管理軟件
1.6 計算化學(xué)應(yīng)用
1.7 計算機(jī)化學(xué)的學(xué)習(xí)方法
1.8 相關(guān)網(wǎng)站及參考書
第2章 chemsketch的使用
2.1 chemsketch概述
2.1.1 主要功能
2.1.2 軟件界面
2.2 結(jié)構(gòu)模式
2.2.1 常用工具與快捷按鈕
2.2.2 基本操作
2.2.3 高級操作
2.2.4 二維優(yōu)化
2.2.5 三維優(yōu)化
2.2.6 模板的應(yīng)用
2.2.7 模板的管理
2.3 繪圖模式
2.3.1 常用工具與快捷按鈕
2.3.2 反應(yīng)能量圖
2.3.3 原子軌道圖
2.3.4 實驗裝置圖
2.4 分子性質(zhì)的預(yù)測
第3章 chembiodraw的使用
3.1 chembiodraw概述
3.1.1 版本介紹
3.1.2 運(yùn)行系統(tǒng)要求
3.1.3 新特性
3.2 chembiodraw工具欄與文檔
3.2.1 工具欄與窗口顯示
3.2.2 文檔操作
3.2.3 頁面設(shè)置
3.3 chembiodraw操作實例
3.3.1 畫丙酮分子
3.3.2 使用環(huán)工具
3.3.3 畫反應(yīng)式
3.3.4 畫中間體
3.3.5 使用碎片工具
3.3.6 畫多點(diǎn)配位結(jié)構(gòu)
3.3.7 費(fèi)歇爾投影式
3.3.8 畫透視圖
3.3.9 畫紐曼投影式
3.3.10 使用立體化學(xué)標(biāo)記
3.3.11 使用模板
3.4 結(jié)構(gòu)式的基本畫法
……
第4章 chembio3d的使用
第5章 gaussian的使用
第6章 gaussview的使用
附錄 能量單位
化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算 節(jié)選
《化學(xué)圖文設(shè)計與分子模擬計算》以著名的桌面化學(xué)辦公系統(tǒng)軟件ChemBioOffice2008和廣泛使用的量化計算軟件Gaussian03的使用為例,采用圖形界面與文字?jǐn)⑹鱿鄬φ盏姆绞剑敿?xì)介紹了化學(xué)圖文設(shè)計和分子模擬計算的方法。內(nèi)容包括:計算機(jī)化學(xué)及化學(xué)模擬的概念與方法;ChemSketch化學(xué)圖文繪制技巧;ChemBioDraw化學(xué)生物繪圖工具的使用方法、結(jié)構(gòu)查詢、結(jié)構(gòu)與性質(zhì)計算;ChemBio3D結(jié)構(gòu)模型構(gòu)建、修改、顯示與輸出的方法和技巧;ChemBio3D中量子化學(xué)接口軟件(MOPAC、Gaussian、Jaguar等)在分子模擬計算中的應(yīng)用;Gaussian03輸入文件的編制、計算作業(yè)的運(yùn)行、計算結(jié)果的觀察等方法;利用GaussView4.1創(chuàng)建、設(shè)置、運(yùn)行與觀察Gaussian輸入/輸出文件的方法。書中采用眾多計算實例,介紹了單點(diǎn)能計算、幾何優(yōu)化計算、頻率計算、高精度計算、化學(xué)反應(yīng)路徑計算、激發(fā)態(tài)的計算和溶液中的模擬等計算方法和計算結(jié)果的查看。
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